【科普】关于Ubiquitination

【科普】关于Ubiquitination

Ubiquitination是post-translation中重要的一项。


它最被人熟知的功能就是可以引导蛋白的降解。但这只是其中一项而已,它还有很多其它的功能,比如:

  • 引导蛋白去哪儿
  • 引导蛋白和另一个蛋白的互动
  • 将kinase给激活
  • 促进receptor的吞噬
  • 帮助DNA的修复和复制
  • 调节基因的转录


由此可见,ubiquitination的调节是非常重要的。


那么ubiquitination标记的原理是什么呢?


Ubiquitination 过程

如上图,E1将ubiquitin传给E2,E2之后和E3:目标蛋白相连,E2再将ubiquitin转给目标蛋白。之后目标蛋白将有一串ubiquitin。


Ub蛋白

Ubiquitin由76个氨基酸组成。它热衷于和NH2连在一起,因此在64个氨基酸中,它最喜欢和Lysine(K)中的NH2相连。下图是Lysine的化学结构。

氨基酸Lysine(K)化学结构


组成Ubiquitin的氨基酸中有很多Lysine (位置上有K6,11,27,29,33,48,63),因此Ub之间串联的方式多种多样。


不同的串联方式所对应的功能也不一样。


举一个K63串联的例子。


如上图所示。一串K63的ub形成一个框架,将TAB1/2:TAK1和IKKg(NEMO):IKKa/b的距离拉近,使得TAK1可以将IKKb磷酸化,IKKb进而磷酸化IkB,使得IkB降解,让NFkB得以释放而进入细胞核,开启一系列的因子。


再举一个K63的例子:

一串K63的ub将NEMO/TANK/Ikk/TBK1激活,进而磷酸化IRF3,使得IRF3进入细胞核,激活一系列的Type1 IFN因子。


总结上面两个关于K63 Ub的例子,即:



Reference:

Sun SC, Nat Rev Immunol., 2008

Janeway's Immunology, 9th edition

编辑于 2017-12-28 10:46