gephi
公众号：知行并重。专注机器学习 图挖掘 金融风控 知识图谱
因为还有朋友私信我说没能安装成功，浪费不少时间精力。我这里做两个补充，希望可以帮到大家： 百度云的下载链接。 链接： https://pan.baidu.com/s/1HOZSBHrOWDTQ7-AOJKXFJA 提取码：ngez2. 2min的 win10 下Gephi的安装视频 欢迎到我的公众号与我交流，图挖掘相关内容 以下是原答案： ------------------- 注意：并不一定要 JDK 7,不要费力去找了 ------------------- 报错:提示Cannot find Java 1.8 or higher解决方案 1 去官网下个最新的 Java SE Develop…
数说故事创始人，大数据、人工智能和未来探索者
正统教材: 主要是下面这两本（第一本好些，虽然第二本好像国内用的比较多）: Pang-Ning Tan, Michael Steinbach and Vipin Kumar, Introduction to Data Mining. Jiawei Han and Micheline Kamber, Data Mining: Concepts and Techniques. 前沿教材: 但比较新的还是推荐Stanford课程讲义总结出来的, 课件也很好。跟传统教材相比，更侧重大规模数据处理的一些技术，例如高维数据分析。 Mining of Massive Dataset, by Anand Raj…
介绍用Gephi进行数据可视化
5G产品经理混迹于欧洲。等赚够了钱，回家画漫画的汉子。
前提介绍：首先感谢 @崔斯特 在抓取数据中对我的协助。这篇文章介绍的是数据可视化(Data visualization)的一些具体应用。 主要用到的工具 Python (抓取数据和分析数据)， Gephi (数据可视化软件) （另外： 我会介绍到两个在Facebook ( Netvizz v1.42 ) 上抓取数据的app）先上图： [图片] 这是以五月天Fan-mily(原May Day Fan-mily) Facebook Group 为收集数据的来源制作的 社交网络关系图。 [图片] 而这幅图是从《哈利波特与魔法石》中提取制…
374名10万+知乎大V（一）：相互关注情况
公众号「牛衣古柳 」/喜欢数据可视化/乃木坂46
一、前言两个月前，今日头条签约了300多名知乎大V，随后引发广大关注和讨论，具体可见： 如何看待今日头条一口气签了 300 多个知乎大 V 的传闻？ 现在虽然热度已消逝，但一些困惑依然存在，到底知乎有多少大V（此处以“10万关注为标准”），他们都是谁？彼此的关注情况如何？存不存在亲疏远近，乃至抱团的情况...... 正所谓有人的地方就有江湖，挖掘下上述数据，或许能窥见到不一样的知乎大V生态圈。 二、爬虫思路 本回以知乎第一…
Gephi | 通用网络分析与可视化
搜索产品
Gephi[1]是一款网络分析领域的数据可视化软件，目标是成为“数据可视化领域的Photoshop”。其前身是由法国巴黎政治学院教师mathieu jacomy于2006年开发的graphiltre，2007年正式更名为gephi 0.5发布[2]，目前最新版本为0.92[3]。 目录一、Gephi主要功能介绍 （一）相关背景 （二）主要功能模块 二、Gephi数据输入方式 三、页面操作介绍 （一）概览界面 （二）数据界面 （三）预览界面 参考教程（一）书籍 1、网络数据可视化与分…
Python数据可视化——Gephi关系网络图
01为什么要数据可视化 最近很多盆友都在如火如荼的学习python等编程语言，利用数据和编程语言来改（升）变（职）世（加）界（薪），是我们的终极梦想。 但我们最终要呈现给客户的不是数据，而是图表、报表等具有可读性的文字和图片，也就是说我们要的是 数据背后的故事。 做为颜控的你，一定知道一份可读性高的报表（图表）不仅能吸引眼球，更能为自己迎来加鸡腿的机会。 正所谓“ 我美，我骄傲”，哈哈哈哈。02数据可视化的工具…
Gephi绘制微博转发图谱：以“@老婆孩子在天堂”为例
公众号「牛衣古柳 」/喜欢数据可视化/乃木坂46
一、前言以前看过一篇提取《釜山行》剧本中人物，并用Gephi绘制关系图谱的文章，因此想用Gephi绘制下微博转发情况，借此来换个角度看看微博内容是怎么扩散的。其中爬取转发数据的思路可见于： 《老树微博，三千诗与画 》，大同小异，不再赘述。而在选择哪则热门微博时，正好看到有人转发了 杭州保姆纵火案受害者家属，林生斌，微博ID：“老婆孩子在天堂”的一则为四川地震灾民捐赠物资的微博，截止周五（20170811）晚上10点20，转…
Gephi的实战又美观的运用 -- 用社会关系图谱筛选作弊用户
上得了厨房蒸煮炖，下得了厅堂编写算
社会网络，由许多节点（node）构成，节点通常是指个人或组织，节点之间发生着社会关系 。社会关系包括朋友关系、同学关系、生意伙伴关系、种族信仰关系等，这些关系构成了节点与节点之间的连接（edge），有的单向联系，有的是双向联系。节点和有向边的交织构成了社会网络。我们把这社会网络用计算机图形展现出来，就形成了社会关系图谱。 社会关系图谱有一些基本的计算指标，用来表示社会关系网络中每个节点的重要性、社交广泛性…
pajek常见指标计算操作+可视化操作
nothing
本文包含常见指标计算与可视化网络等：度中心性+中心势，Closeness centrality+closeness centralization，Betweenness centrality+Betweenness Centralization，本征矢量中心度+本征矢量中心势。 下载pajek： Program Package Pajek / PajekXXL 适于中文的制备网络文件的软件及其用户指南，生成.net、.clu和.paj文件，供Pajek调用： 有人说网盘失效了 补充下应该是这个 hi，这是我用百度网盘分享的内容~复制这段内容打开「百度网…
Gephi--简单易用的网络图绘制工具
本期给大家推荐一款网络图绘制工具--Gephi。该工具简单、易用而且中文友好，非常适合初学者使用。 先给大家看看出图效果： [图片] [图片] [图片] 前二图都是Gephi自带的示例，图三是小编自己的一份简单数据。接下来会把图三的绘制过程一步一步地展示出来，供各位看官参考学习。 01软件介绍及下载安装 Gephi是一款开源、免费软件，可用于各种图形和网络的可视化和探索，是最受欢迎的网络可视化软件之一。在生物科学领域，常用于基因共表达网络、蛋白…
图分析与可视化-从Gephi开始
图分析与可视化
经常有朋友问“那些网络图怎么做出来的呀？”。 其实要画出漂亮、高大上的网络图所需的操作并不复杂。从现在开始尽量多输出一些文章，跟大家分享我们是怎么做出那些网络的。 首先从Gephi-开始介绍，虽然目前也有一些相关介绍文章，我们从自身的经验与理解出发，给大家一些更加多样的参考。希望大家多支持，多交流！ [图片] Gephi启动画面 Gephi是一款开源免费跨平台基于JVM的复杂网络分析软件,，其主要用于各种网络和复杂系统，动态和…
共享单车模式分析和社区发现（Networkx+Gephi）—以上海为例
公众号【交通科研Lab】数据挖掘 交通建模 科研分享
小伙伴们!之前的推送简单介绍了Networkx的功能，本次推送继续使用Networkx进行数据的分析，主题是共享单车模式分析和社区发现，思路主要来自以下两篇论文（论文见文末百度云链接~）： [图片] [图片] 下图是论文1中的配图，本次推送一部分的内容就是复现这个图！另一部分内容是复现论文2中的社区发现。图的复现用到的软件主要是Gephi,社区发现算法用到的是Networkx。 [图片] 本次推送用到的数据是 上海市共享单车数据（公众号内资料下载的资料一期）…
pagerank和personalized pagerank
算法工程师
关于pagerank，应该拆解来看比较容易理解，需要注意， pagerank的设计是基于有向图的，当处理无向图时，实际上是把无向图当作一个双向图来进行计算的，因此下文主要从有向图的角度出发来理解pagerank，对于无向图来说是同样适用的。 [图片] 1.pagerank实现了和in-degree类似的功能，对于某个节点来说，其in-degree越大则节点越 流行；2.pagerank在in-degree的基础上更近一步，具体来说，两个in-degree相同的节点A和B，并不一定节点A和节…
哪怕抛掉出身的因素，我觉得未必比得过别人
推荐我写的这个 jsoncsv python 命令行工具以及相应的网站 alingse/jsoncsv 在线 JSON 转 CSV 简单易用，无须约定 JSON 为相同 schema 的，也不需要在转换时候去声明导出的 key 即支持 异构 +多层的 JSON原理原理可以参考这篇回答 如何自动做json扁平化？ 第一步 扁平化将 JSON 的树状结构转换为 [(path, value), (path, value)] 的数组， 这里的 PATH 是按照一定的规律编码的 # 原始 JSON {"user": {"name": "hello", "age": 30}, …
Gephi——基于插件Map of countries和Geo layout的地理坐标网络可视化
公众号【交通科研Lab】数据挖掘 交通建模 科研分享
小伙伴们!之前的推送简单介绍了可视化功能强大的 Gephi，本次推送继续使用Gephi进行网络的可视化。以下内容基于Gephi(0.9.2)。由于很多交通数据都是地理数据（包含经纬度），考虑经纬度的网络可视化是很有必要的，本次主要介绍Gephi的Geo layout插件和Map of countries插件，其可以根据经纬度将网络节点分开。 一、Geo layout和Map of countries首先介绍一下Geo layout，它是Gephi布局中的一种，示意图如下所示。Geo layout是使…
Gephi安装中出现cannot find Java 1.8 or higher
教育技术学
今天换了一台新电脑，把常用的数据分析软件安装了一遍。。在安装Gephi 0.9.2版本时提示我cannot find Java 1.8 or higher。这是说Java版本太低，或者没有安装Java。我就去下载最新版本的Java，安装后打开Gephi仍然出现这样的问题。于是就找度娘，现在问题解决了。 我把问题解决的方法放在这里，需要的朋友可以看看。 1.首先找到Gephi的安装路径（默认在C盘的目录中），找到etc文件夹，用记事本打开gephi.conf文件； [图片] 2.然后，打开…
书到用时方恨少
我也遇到这个问题，因为明天就要用，从晚上12:00弄到现在凌晨3:27，终于弄好了。 失败的原因：从网上搜到要安装Java和jdk，于是直接到Java的官网安装了最新版的Java8和jdk8，结果无论如何都打不开gephi。然后看到有人说找到gephi.conf文件（在“gephi安装目录\etc”中）文件，添加下面的一行，指定jdkhome的路径 jdkhome="C:\Program Files (x86)\Java\jre7”，可是这个文件是conf类型，改完后无法正常保存。作罢。 成功的办法：…
生物信息工具 | 如何绘制“上流”的共发生网络图？
专业定制测序服务。我们的愿望是，助您达到更高的科研领域。
| 撰文：莫北在之前《如何用Gephi绘制漂亮的网络图》一文中，已经为大家介绍过如何使用Gephi绘制下图这样的共发生网络图（Co-occurrence network），该文主要是介绍通过准备“ 边文件”和“点文件”来创建网络图。 [图片] 但有时候绘图比较容易，难的是准备数据。前文也提过，最常见的共发生网络分析过程是先计算相关系数矩阵，接着使用igraph生成gml格式的网络图文件，最后导入Gephi对网络图进行个性化绘制。 当然，如果你不愿使用R语…