gephi
这个人有时很好笑 一直很能吃
节点表格内除了id，label之外，可以另外自定义属性，在导入节点表格的时候，注意勾选值的类别为float或double。导入成功后，在概览的排序部分就可以设置节点的自定义属性了。
读书/数据分析/摄影爱好者
使用Python Pandas 数据分析工具。 首先读入json数据，使用read json()方法即可，该方法直接将json数据读取为DataFrame对象。import pandas as pd json_data = pd.read_json('planets.json') json_data.head() out: method number orbital_period mass distance year 0 Radial Velocity 1 269.300 7.10 77.40 2006 1 Radial Velocity 1 874.774 2.21 56.95 2008 2 Radial Velocity 1 763.000 2.60 19.84 2011 3 Radial Velocity …
pagerank和personalized pagerank
算法工程师
关于pagerank，应该拆解来看比较容易理解，需要注意， pagerank的设计是基于有向图的，当处理无向图时，实际上是把无向图当作一个双向图来进行计算的，因此下文主要从有向图的角度出发来理解pagerank，对于无向图来说是同样适用的。 [图片] 1.pagerank实现了和in-degree类似的功能，对于某个节点来说，其in-degree越大则节点越 流行；2.pagerank在in-degree的基础上更近一步，具体来说，两个in-degree相同的节点A和B，并不一定节点A和节…
Gephi
等待一个工作机会~
一、Gephi安装开源软件，官网：The Open Graph Viz Platform 2. 点击Download FREE [图片] 3. 根据电脑系统下载相应安装包 [图片] 4. 安装相应的java环境——Java Development Kit (JDK) X64下载地址 https://www.oracle.com/java/technologies/javase-jdk16-downloads.html 二、简单使用步骤1.先使用ROST CM6进行简单的社会网络语义分析，见 一颗琉星：rostcm6 （3.社会网络和语义网络分析）2.打开共词矩阵的Excel，将其另存为.csv格式 [图片] [图片] 3.打开Gephi软件，点击新建工程 [图片] 4.打开3中的.csv文件 [图片] 5.下一…
生物信息工具 | 如何绘制“上流”的共发生网络图？
专业定制测序服务。我们的愿望是，助您达到更高的科研领域。
| 撰文：莫北在之前《如何用Gephi绘制漂亮的网络图》一文中，已经为大家介绍过如何使用Gephi绘制下图这样的共发生网络图（Co-occurrence network），该文主要是介绍通过准备“ 边文件”和“点文件”来创建网络图。 [图片] 但有时候绘图比较容易，难的是准备数据。前文也提过，最常见的共发生网络分析过程是先计算相关系数矩阵，接着使用igraph生成gml格式的网络图文件，最后导入Gephi对网络图进行个性化绘制。 当然，如果你不愿使用R语…
不求甚解。
Gephi 有个multi color render 的插件，加个colourList的属性，然后里面填十进制rgb 的数字，多个就逗号分隔，在预览页里就能看到了，具体的在这个插件作者的github的issue里有
零代码 | 查找适合的GEO数据 | 韦恩图和火山图绘制
同名公众号：云生信学生物信息
大家好！今天小编跟大家分享一下如何在GEO数据库中找到适合自己的数据。下面就让小编手把手教您如何进行GEO数据的下载和分析吧。 1. 如何查找适合的GEO数据并下载GEO数据库最常用的有两种方式，一种是通过网址 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo 直接进入，另外一种就是通过pubmed入口啦。接下来咱们就进入正题。PS：前方多图预警。GEO数据库最常用的入口当然是Pubmed入口啦，简单粗暴：Step1. 先选择GEO DataSets，然后点击Search； Step2. …
图数据结构，能够很自然地表征现实世界。图的可视化，可以帮助我们直观的感受实物之间的关联关系，给予直接的视觉冲击。本篇介绍几种图（Graph）可视化工具， 包括Networkx, Neo4j, Dgraph。 [图片] 图的介绍和定义参考，本系列文章： [文章: 图(Graph)的定义] 图数据模型： LuckyBoy：什么是图数据模型？ 1. Networkx简介：networkx在2002年5月产生，是一个用Python语言开发的图论与复杂网络建模工具，内置了常用的图与复杂网络分析算…
生物信息工具 | 这种好看的“朱缨花”网络图怎么用Gephi绘制？
专业定制测序服务。我们的愿望是，助您达到更高的科研领域。
撰文：莫北在之前的《 如何绘制漂亮的网络图？ 》和《如何绘制“上流”的共发生网络图？ 》两篇文章已经介绍过网络图数据准备与个性化调整。不过，有小伙伴又问啦，下面这篇文献中好看的网络图是如何绘制的？ [图片] 其实绘制这样的网络图，完全取决于你数据“关系对”的特征。 通过观察上图我们可以发现，图中的6个“hub” 结点有大量的“独有”或“共有”的节点，而“hub” 结点两两之间的共有节点却较少。因此，数据符合这样的特征就可…
一位专注于数据分析、数据挖掘滴工程师
需求确认：将json数据转化为csv的数据格式JSON可以有两种格式，一种是对象格式的，另一种是数组对象格式 {"name":"JSON","address":"通州","hight":175}//对象格式 [{"name":"JSON","address":"朝阳","hight":178}]//数组对象格式 这里介绍其中一种：数组对象格式[ { "ttery": "min", "issue": "20130801-3391", "code": "84529", "code1": "297734529", "code2": null, "time": 1013395466000 }, { "ttery": "min", "issue": "2…
研究员
解决思路是，别用自己新建的csv，而是用gephi导出的csv，在里面输入你的资料，再导入。 步骤如下： 1.进入gephi，打开自带的一个样本 2.将样本的边数据导出，导出的是一个csv 3.将你要导入gephi的边数据复制粘贴到这个csv中（我是几列几列的复制，全部复制粘贴没有试过），保存 4.用gephi导入这个csv，毕
Gephi绘制微博转发图谱：以“@老婆孩子在天堂”为例
公众号「牛衣古柳 」/喜欢数据可视化/乃木坂46
一、前言以前看过一篇提取《釜山行》剧本中人物，并用Gephi绘制关系图谱的文章，因此想用Gephi绘制下微博转发情况，借此来换个角度看看微博内容是怎么扩散的。其中爬取转发数据的思路可见于： 《老树微博，三千诗与画 》，大同小异，不再赘述。而在选择哪则热门微博时，正好看到有人转发了 杭州保姆纵火案受害者家属，林生斌，微博ID：“老婆孩子在天堂”的一则为四川地震灾民捐赠物资的微博，截止周五（20170811）晚上10点20，转…
https://twiknight.github.io
json不能直接转化为csv，因为它们根本不是存同一类东西的。json的本质是字典，是hash表，用来存储非结构化的数据。 csv本质是表，用来存储结构化数据（虽然实际上你存什么没人管）。 想把json转成csv，核心问题只有一个： 如何把非结构化的数据处理成结构化的这个问题解决起来有最简单的思路有两个： 配置。让程序决定json里的非结构化数据应该如何处理。约定。规定json按照某种格式来写。这两种方式各有适用的场景。配置的思路…
1.尝试了一下： Source,Target 1,2 2,3 3,1 这样就可以导入，但是软件会把Source，Target也当做两个节点，你进去删了就行 没有Source,Target不能导入 2.推荐使用gdf格式，官网有介绍，很好用
社会网络分析指导，社会网络分析建模，社会网络分析交流
课程设计代做，作业代做，各种技术服务，有不懂的可以问
社会网络建模，复杂网络分析，经济网络分析，社会网络分析，专利网络分析，情报网络分析，pajek作图，ucinet分析，结构洞分析，gephi作图，对社会网络分析不懂的可以问。
Gephi绘制微博转发图谱：以“@老婆孩子在天堂”为例
公众号「牛衣古柳 」/喜欢数据可视化/乃木坂46
一、前言以前看过一篇提取《釜山行》剧本中人物，并用Gephi绘制关系图谱的文章，因此想用Gephi绘制下微博转发情况，借此来换个角度看看微博内容是怎么扩散的。其中爬取转发数据的思路可见于： 《老树微博，三千诗与画 》，大同小异，不再赘述。而在选择哪则热门微博时，正好看到有人转发了 杭州保姆纵火案受害者家属，林生斌，微博ID：“老婆孩子在天堂”的一则为四川地震灾民捐赠物资的微博，截止周五（20170811）晚上10点20，转…
Gephi的使用--以社交网络图为例
一. 导读目前数据可视化大多都以图形界面为主，傻瓜的安装，方便快捷的操作，现代化的版式，便捷的分享和导出。 本文介绍一款开源网络可视化软件----Gephi.Gephi用来做网络的图形化展示，主要应用如下： Exploratory Data Analysis: intuition-oriented analysis by networks manipulations in real time.Link Analysis: revealing the underlying structures of associations between objects.Social Network Analysis: easy cr…
哈哈哈
第一步：下载geghi 地址： http://gephi.org 第二步：下载java 地址： http://www.java.com/zh_CN/ 第三步：配置Java环境变量 右击计算机——属性——高级系统设置——环境变量——系统变量处点击新建——变量名：JAVA-HOME，变量值：C:\Program Files（x86）\Java\jre1.8.0_161（JAVA在自己电脑中安装的位置）——确定 第四步：找到 gephi.conf 文件（在“gephi安装目录\etc”中）。用写字板打开，将jdkhome="C:/Program Files (x86)/Ja…