未来有没有可能出现集机场、地铁（轻轨）站、高铁站、商业中心于一体的建筑？

比起虹桥我觉得日本的几个轨道交通综合体更符合题主的说法。

建筑基本上要这么安排。轨道交通在地下。机场航站楼层需要和高铁候车层需要直接与地面的停机坪和站台联通，人流很大，所以肯定设在低层，或者将航站楼设在一层。高铁候车层由于要给火车轨道让行必须设置天桥或者借用建筑本身的一部分形成天桥，所以即使设置在一层也需要上下天桥，故设置在上层较合理。另外机场和火车站都需要独立的出入口。上面的层留给商业，也需要一个单独出入口。

难度的话，主要是不同目的的人流如何引导，以及由于人流的多样性带来的停车需求非常复杂。外加飞机噪音对商业的影响吧。