预防呼吸道病毒感染和预防其它传染病类似，三个环节包括控制传染源，切断传播途径，保护易感人群。如疾病所有感染者均有症状或症状较严重，即需做好控制传染源，以控制疾病的传播。如当年的SARS及2012年出现的MER，即中东呼吸综合征，其感染者症状均较明显，需将所有感染者均进行隔离，降低传播性。但其它的一些呼吸道传染病，如感冒、流感及新型冠状病毒肺炎，常有轻型感染者，甚至无症状感染者，难以被识别，无法完全控制传染源。
还要做好第二个环节，即切断传播途径。在流行期间，所有人均需戴好口罩，外出去人多、空气流通不好场所，均需戴好口罩进行保护。需注意手卫生，尽量避免被患者的呼吸道分泌物污染后用手揉眼睛、摸口鼻。患者粪便、尿液可能也有传染性，故卫生间也需戴好口罩、经常开窗通风。另外，要注意保护易感人群，流感等呼吸道传染病已有疫苗，但需每年接种。对新型冠状病毒预防主要做到隔离传染源、切断传播途径。
