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复旦大学基础医学院前身为上海第一医来自学院基础医学部,建于1955年4月。1992年12月基础医学部更名为基础医360百科学院。2000年4月,上海医科大学和复旦大学合并,组建为新的复旦大学。2照001年7月27笔苗亚日,撤销复旦大学基础医学院、临床医学院建制,组建复旦大学医学院,2002年更名为复旦大学上海医学院。2012年9月4笑院日,恢复复旦结活均苦大学基础医学院建制。学院入选国家理科基础教育和教学人才培养基地、上海高校一流学科(A类)建设计即学的跑听司达接掌划、首批全国党建工作标杆院系培育创建单位。
据2019年3月学院官网显示,基础医学院以二级学特材决曲乙实军组提科为基本单位,下设12个系;8个研究中心、研究室;1钟政虽它你个国家重点实验室委美亚行去;2个教育部重点实验室;2个卫生部重点实验室及1个上海市重点实验室。学院拥有国家一级重点学科3个,国家二级重点学科7个。学左院设有博士后科研流动站3个,一级学科博士点6个,二级学科博士点16个,硕管镇效士点16个,本科专业2个。在读本科生1076人(其中留学生85人),硕士研究生225人,博愿车引察以束士研究生331人。有教职员工324人。