致炎因子持续存在并且损伤组织是发生慢性炎症的根本原因。各种器官的慢性炎症除从急性炎症转化而来外，是还可以其他方式发生。急性炎症反复发作，而发作间期无明显症状也是慢性炎症，如慢性胆囊炎、慢性肾盂肾炎等。慢性炎症还可潜隐缓慢地逐渐发生，临床上开始并无急性炎症表现，常见于细胞内感染(如结核杆菌、病毒感染)，这些病原体的毒力不强，但可引起免疫反应;或长期受不能降解却有潜在毒性物质的刺激(如矽肺)船;或持续存在的、对抗自身组织的免疫反应即自身免疫性疾病(如类风湿性关节炎)。