Cu来自fflinks 利用王测扩沿Tophat比对的结果(alignments)来组装转录本,估计这些转录本的丰度,并且检测样本间360百科的差异表达及可变剪接。这个软件其实是个套装,包括四个部分老考坐分别命名为:cufflinks、cuffcompare、cuffmerge及cuffdiff