抗甲状腺过氧化物酶抗体高是一种自身免疫性的甲状腺损伤，或叫做自身免疫性的甲状腺疾病。
这种抗体是由于人体自身白细胞攻击了自己的甲状腺组织导致的抗体升高，就像把甲状腺细胞当成了细菌或病毒进行攻击或清除，就会产生相应的抗体，甲状腺过氧化物酶抗体实际上就是白细胞。
针对甲状腺非常重要的酶，过氧化物酶产生的抗体，就会降低甲状腺细胞过氧化物酶的活性，导致甲状腺细胞的慢性损伤，甚至是甲状腺细胞的死亡。长期甲状腺过氧化物酶升高会导致甲状腺功能减退。
但不同的人发生的时间有长有短，有的人可能甲状腺过氧化物酶高了几十年，也没有发生甲减。但是总之，有甲状腺过氧化酶抗体阳性的人就更容易发生甲状腺功能减退，这就是它对人体最大的危害。