...phenoData@data exprset hkgset@assayData[[ exprs ]] hkgset@featureData@data gpl$Entrez Gene as.character AnnotationDbi::select(org.Mm.eg.db,keys=...
org.Mm.eg.db , enrichplot , DOSE , msigdbr )) library(clusterProfiler) library(org.Mm.eg.db) library(enrichplot) library(msigdbr) # 获取 MSigDB 基因集 ~~~ --- ### ߓ� 第二步:准备排序基因列表(Ranked Gene List) GSEA 需要一个按 与表型相关性 排序的基因列表。我们用 ~t-statistic~ 作为排序依据。 ~~~r # 选择你想分析的对比,例如:Luteolin_vs...